TABLE 1.

Identification of bifidobacterial isolates by different molecular methods

IsolateSpecies (identified by species-specific PCR primers)Species identification confirmed by 16S rDNA sequenceIdentification by transaldolase (migration in DGGE)
A6a B. longum NDa B. longum I
HB2 B-1 B. longum ND B. longum I
NH1-B2 B. longum ND B. longum I
GT10-1C B. longum B. longum B. longum I
JBA1 B-1 B. longum ND B. longum I
MH B-1 B. longum B. longum B. longum II
GT9 T-1C B. adolescentis ND B. adolescentis I
GT FOS1 B. adolescentis B. adolescentis B. adolescentis I
GT FOS8 B. adolescentis B. adolescentis B. adolescentis I
MH2 B-10 B. adolescentis ND B. adolescentis I
MH2 B-2 B. adolescentis ND B. adolescentis I
HB2 B-3 B. adolescentis ND B. adolescentis I
A12 B. adolescentis B. adolescentis B. adolescentis II
A15 B. adolescentis B. adolescentis B. adolescentis III
JB1 B-1 B. adolescentis ND B. adolescentis IV
KB1 B. adolescentis ND B. adolescentis IV
ALM2 B-2 B. adolescentis ND B. adolescentis IV
HB1 B-5 B. adolescentis B. adolescentis B. adolescentis IV
JB4 T-1C B. adolescentis ND B. adolescentis IV
G1 B. adolescentis B. adolescentis B. adolescentis IV
NH2 B-5 B. adolescentis B. adolescentis B. adolescentis V
G2 B. catenulatum group B. pseudocatenulatum B. pseudocatenulatum I
NH1 B-4 B. catenulatum group B. pseudocatenulatum B. pseudocatenulatum I
G4 B. catenulatum group B. pseudocatenulatum B. pseudocatenulatum II
G3 B. catenulatum group B. pseudocatenulatum B. pseudocatenulatum II
G3a B. catenulatum group B. pseudocatenulatum B. pseudocatenulatum II
JB FOS5 B. bifidum ND B. bifidum
  • a ND, not done.